Gracze grający w „EteRNA” Just Beat Professional Science do tego przełomowego odkrycia

Nauka obywatelska poszła o krok dalej: gracze wideo dokonali odkrycia biologicznego, a teraz zostało opublikowane przez recenzowane czasopismo naukowe.

Opublikowano w tym tygodniu w Journal of Molecular Biology, seria intuicyjnie opracowanych reguł, jak trudny będzie określony kształt do osiągnięcia przez projektowanie RNA. Odkryli na przykład, że im bardziej symetryczny jest kształt, tym trudniej będzie zaprojektować pasmo RNA, które będzie do niego pasować.

Zespół graczy wideo dokonał odkrycia, grając, EteRNA, gra, która prowokuje graczy do pobierania nici RNA i składania ich w pożądany kształt poprzez zmianę ich składu chemicznego. Naukowy problem składania RNA w konkretny kształt jest złożony, ale gra nie jest - nie trzeba rozumieć biochemii, aby rozpocząć grę.

Gracze podjęli pytanie badawcze z własnej inicjatywy, jako sposób na udostępnienie nowszym graczom narzędzi do oceny względnej trudności różnych łamigłówek. Odkrycia pomogą w przyszłych badaniach biomedycznych, ponieważ nowy zestaw zasad daje naukowcom lepsze poczucie, czy próba złożenia RNA w dany kształt jest daremnym ćwiczeniem.

„Badania te sugerują, że standardowy paradygmat naukowego crowdsourcingu można odwrócić”, mówi Rhiju Das, profesor biochemii w Stanford Odwrotność w wiadomości e-mail. EteRNA został uruchomiony w 2011 roku przez Dasa i Adriena Treuille, adiunkta informatyki na Carnegie Mellon University. „ EteRNA gracze mogą opracować własne pytania badawcze i napisać własne prace. W ramach tych badań przeprowadzono niewielkie wskazówki i niezależne testy od ekspertów z mojego laboratorium. ”

Syntetyzowany RNA ma niesamowity potencjał dla nowej generacji leków i terapii medycznych. Jeśli można go złożyć w odpowiedni kształt, RNA można zbudować w celu ukierunkowania na określone wirusy, nowotwory, a nawet zaburzenia genetyczne. CRISPR, proces edycji genów, który może radykalnie zmienić przyszłość ludzkiej egzystencji, wykorzystuje RNA do prowadzenia enzymu tnącego DNA, Cas9, do niepożądanej części DNA.

EteRNA Zaczęło się jako forum dla ekspertów-naukowców, którzy mogli przedstawić łamigłówki graczom, ale od tego czasu wzrosły. Gra i jej 100 000 zarejestrowanych graczy istnieją obecnie w symbiotycznej i ewoluującej relacji z profesjonalnymi naukowcami i komputerowymi modelami zaprojektowanymi do projektowania i testowania struktury RNA.

„Modelowanie komputerowe i EteRNA nie są wyłączne ”, mówi Das. „ EteRNA gromadzi wielu ludzi, z których niektórzy piszą własne modele komputerowe. ”

W obecnym artykule gracze wspólnie napisali skrypty, aby przetestować swoje pomysły na to, co sprawia, że ​​konstruowanie RNA jest trudne. Das mówi, że niektórzy gracze powiedzieli mu, że są szczególnie podekscytowani automatyzacją swoich pomysłów na modele komputerowe, ponieważ chcą kontynuować i rozwiązywać trudniejsze problemy.

Problemy budowane przez EteRNA gracze w rzeczywistości są syntetyzowani w laboratorium Das - do tej pory zbudowano 86 459 sekwencji wygenerowanych przez gracza IRL.

Głównymi autorami pracy były EteRNA gracze Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju i Michelle Wu. Wu jest także doktorem student informatyki biomedycznej w Stanford.

W przyszłości może się zdarzyć, że eksperci obywatelscy zaczną publikować odkrycia naukowe całkowicie niezależnie.

„Ten„ odwrócony crowdsourcing ”szablon dla nauki obywatelskiej może być przydatny w innych projektach i dziedzinach nauki, takich jak astronomia (Galaxy Zoo) lub identyfikacji gatunków pochodzących z tłumu (Barcode of Life), ”Mówi Das. „Zwłaszcza jeśli, jak EteRNA, widzimy wąskie gardła na etapie pisania papieru. ”